食品科学技术学院是河南农业大学重点发展的学院之一。1987年，经国家教委批准，在农学系设农产品贮运与加工专业。1994年11月，学校进行专业调整，撤系建院，成立生物工程学院。2001年12月，撤销生物工程学院，成立生物技术与食品科学学院。2005年1月，成立食品科学技术学院。
学院拥有一支团结、敬业、拼搏、创新的高水平师资队伍，现有教职工87人，教授和副教授35人，国家产业技术体系岗位科学家1人，河南省学术技术带头人1人，河南省政府特殊津贴专家2人，河南省教育厅学术技术带头人4人，省高校青年骨干教师5人，省高层次人才5人。近年来，学院承担国家“十三五”和“十四五”重点研发计划项目、国家自然科学基金、河南省重大科技专项等国家级与省级科研与教研项目80余项。通过省级评价成果30余项，获河南省科技进步二等奖4项，三等奖3项，获批国家专利60余项，发表论文1000余篇，其中SCI、EI收录300余篇。
学院积极加强对外交流，在业界具有较强的影响力，先后加入了国家肉类产业技术创新战略联盟、国家速冻产业技术创新战略联盟、国家食药同源产业科技创新联盟;积级与企业开展合作，服务地方经济发展。教学工作中，按照“学生中心、产出导向、持续改进”的基本理念开展教学工作，积极推进“产教融合、协同育人”的实践教学模式，与双汇集团、三全食品、统一企业、河南省农科院等知名食品企业与科研机构共建实习基地20余个。学生的工程实践能力与综合素养得到了行业的高度评价。
在建设“双一流”大学的进程中，学院以成为对区域食品科学技术发展有重要支撑作用的教学研究型学院为目标，以人才培养为根本，立足河南，面向全国，抢抓机遇，积极进取，不断开创学院发展新局面。