重庆大学自动化学院前身是重庆大学自动化系，始建于1959年重庆大学无线电系的自动控制专业。1979年，由无线电系的计算机专业、自动控制专业、电机系的工业自动化专业和动力系的自动化仪表专业组成重庆大学计算机及自动化系，1986年与自动化相关专业成立自动化系，1998年成立自动化学院。学院具有本科、硕士、博士研究生和博士后研究的人才培养体系；主要从事自动控制理论及应用技术、运动控制技术及系统、过程控制技术及系统、检测技术及自动化仪表、人工智能理论及应用、计算机信息管理技术及系统、工业网络技术、物流工程技术及物流管理等方向的优秀工程技术人才的培养和科学研究工作。

　　学院设立控制理论与控制工程系、信息工程与自动化系、物流工程系。学院拥有“控制理论与控制工程”国家211工程重点学科、国家985工程三期重点建设学科、控制科学与工程“十五”、“十一五”和“十二五”重庆市重点建设学科、“控制科学与工程”博士后流动站、“控制理论与控制工程”专业工学博士学位授权点，以及控制科学与工程（0811）一级学科硕士学位授权点（下设的“控制理论与控制工程”、“模式识别与智能系统”、“检测技术与自动化装置”、“系统工程”、“导航制导与控制”五个二级学科具有工学硕士学位授权点）、“交通信息工程及控制”（082302）二级学科硕士学位授权点；在“先进制造”专业招收和培养工程博士；在控制工程、软件工程、物流工程和工业工程领域招收和培养工程硕士研究生；设有自动化和物流工程两个本科专业，其中自动化专业为重庆市优势特色专业。

　　2012-2015年学院在校平均本科生1125人/年、在校博士研究生99人/年，在校硕士研究生370人/年，为社会输送自动化专业技术人才494人/年；近3年来，在控制工程领域、软件工程领域和物流工程以及工业工程领域为企业培养工程硕士研究生达到292余人。

　　学院具有良好的面向本科和研究生的教学实验基地以及科学研究环境，拥有国家985工程科技创新平台多目标测控与高精度测控研究中心、信息物理社会可信服务计算教育部重点实验室、科技部无线电能传输技术国际联合研发中心、中新无线电能传输技术国际联合研发中心、无线电能传输技术重庆市工程技术研究中心、重庆市交通物联网工程技术研究中心、重庆市控制与智能系统新技术工程实验室、重庆市智能交通（ITS）工程技术研究中心、智慧系统与新能源技术研究院、自动控制研究所、智能控制研究所、自动化仪表研究所、系统工程与导航制导研究所、海云天信息影像新技术研发中心等研究机构；同时设有“自动化工程”重庆市重点实验室、国际一流水平的“重庆大学罗克韦尔自动化实验室”、国内一流水平的“重庆大学控制基础实验教学中心”、“机器人创新实验室”及“自动化学院全日制专业学位研究生校内实践实训基地”。

　　学院现有教职工人员90人，其中教授14人，副教授40人，81.33%的专任教师具有博士学位，“海外名师”入选者1人，“高端外国专家”入选者2人，“教育部新世纪优秀人才支持计划”2人，“重庆市青年拔尖人才”1人，“重庆大学百人计划”4人，客座教授和兼职教授30余人。近3年来，自动化学院承担国家973、863计划高科技项目、国家“十二五”科技攻关项目、国家自然科学基金项目、省部级科技攻关重点项目科学研究和科技开发项目以及横向项目131项，获国家、省部级科技奖励7项；在国际国内重要学术刊物或学术会议上发表论文499篇，科技专著3部、专利300余项，并多次主办和协办国际学术会议和全国性学术会议，多项科研成果达到国际国内先进水平。经过三十多年的发展，学院在科学研究与技术开发方面已形成自身的特色，如“智慧系统与新能源技术”、“无线电能传输技术”、“先进检测与智能系统”、“信息物理系统的智能感知与控制”、“传感控制与先进集成技术”等研究方向已在西部地区控制科学与工程领域具有显著优势。