中心实施以第一责任导师为主的导师组联合指导培养方式，并建立多学科交叉培养机制。

　　1.对于学术学位研究生(交通运输规划与管理、工商管理)，导师组由一名主干学科方向的导师作为第一责任导师，一名交叉学科方向的导师，和一名主干学科青年教师的导师构成，对研究生进行跨学科联合指导。以强化跨学科主干理论课程教学，提高科研创新能力为导向，实施以科学研究为核心的学术型研究生考核、监督和评价体系。中心侧重系统科研训练，以前沿性、高水平的科学研究支撑学术型研究生培养；中心依托国家自然科学基金以上级别的高水平基础科研项目指导研究生选题及研究，加强学术创新能力培养；中心优先硕博一体化培养，鼓励学生申请硕博连读。

　　2.对于专业学位研究生(交通运输)，导师组由一名交通运输工程学科方向的导师作为第一责任导师，一名工商管理学科方向的导师，和一名中心协同单位的企业导师构成，对研究生进行跨学科联合指导。以强化产学联合培养，培养提升职业能力为导向，实施以创新项目为核心的专业型研究生考核、监督和评价体系。培养过程中充分发挥中心协同企业在培养标准制定、实践教学改革等方面的指导作用。中心侧重行业案例教学，改革教学内容和授课方式；中心依托协同企业科研合作项目指导研究生选题及研究，并指派学生到中心协同企业的实践基地进行一年的实践能力训练、加强基于技术创新的实践能力培养。